Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms