Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmod2Q9JKK7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmod2Q9JKK7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmod2Q9JKK7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmod2Q9JKK7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod2Q9JKK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Tmod2Q9JKK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Tmod2Q9JKK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod2Q9JKK7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms