Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx6Q9JKK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms