Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms