Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms