Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx20Q9JJY4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms