Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms