Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms