Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tssc4Q9JHE7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tssc4Q9JHE7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms