Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn12Q9ET43 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn12Q9ET43 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms