Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms