Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms