Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn2Q9ER65 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms