Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn4aQ9ER60 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms