Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf8Q9EQH4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf8Q9EQH4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms