Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms