Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold3Q9EQ28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms