Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SgshQ9EQ08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms