Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfgap1Q9EPJ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arfgap1Q9EPJ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms