Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aph1cQ9DCZ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aph1cQ9DCZ9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms