Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms