Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn3Q9DCB1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms