Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms