Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms