Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms