Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms