Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5oQ9DB20 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms