Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim23Q9DAL0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim23Q9DAL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms