Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift43Q9DA69 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms