Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DA42 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DA42 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DA42 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms