Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgf29Q9DA08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms