Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsph9Q9D9V4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms