Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cib4Q9D9N5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib4Q9D9N5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib4Q9D9N5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib4Q9D9N5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib4Q9D9N5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cib4Q9D9N5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms