Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg7Q9D906 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms