Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SlirpQ9D8T7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms