Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms