Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8Q6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms