Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c6Q9D8P7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms