Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms