Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms