Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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