Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms