Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23bQ9D662 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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