Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ccdc39Q9D5Y1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc39Q9D5Y1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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