Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn11Q9D572 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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