Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zcchc13Q9D548 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Zcchc13Q9D548 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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