Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms