Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms