Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5530401A14RikQ9D3H9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms