Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsig1Q9D2J4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms